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Alex Di Genova ● Profesor Asociado

Grado Académico

Doctor en Ingeniería de Sistemas Complejos, Universidad Adolfo Ibáñez

Título(s) Profesional

Ingeniero en Bioinformática, Universidad de Talca

Descripción

Alex Di Genova es Ingeniero en Bioinformática de la Universidad de Talca y Doctor en Ingeniería de Sistemas Complejos de la Universidad Adolfo Ibáñez. La línea de investigación del Dr. Di Genova se centra en el desarrollo de nuevos algoritmos para el análisis de datos genómicos. El Dr. Di Genova ha publicado más de 30 artículos científicos en revistas ISI, ha participado en proyectos genómicos nacionales e internacionales y ha contribuido dos programas de código abierto para ensamblar secuencias genómicas. Actualmente el Dr. Di Genova está desarrollando nuevos métodos y algoritmos computacionales para caracterizar reordenamientos genómicos en distintos tipos de cáncer humano, con el objetivo de comprender como estos procesos mutacionales contribuyen en la progresión y evolución de esta enfermedad.

En el Instituto de Ciencias de la Ingeniería, Alex Di Genova participa en el área de Biología computacional y Biotecnología.

Publicaciones

19

Proyectos

5

Publicaciones

Multiomic analysis of malignant pleural mesothelioma identifies molecular axes and specialized tumor profiles driving intertumor heterogeneity

• Alex Di Genova • Lise Mangiante • Nicolas Alcala • Alexandra Sexton-Oates • Matthieu Foll

DOI: http://dx.doi.org/10.1038/s41588-023-01321-1

A molecular phenotypic map of malignant pleural mesothelioma

• Alex Di Genova • Lise Mangiante • Alexandra Sexton-Oates • Catherine Voegele • Lynnette Fernandez-Cuesta

DOI: http://dx.doi.org/10.1093/gigascience/giac128

Genome sequencing and transcriptomic analysis of the Andean killifish Orestias ascotanensis reveals adaptation to high-altitude aquatic life

• Alex Di Genova • Gino Nardocci • Rodrigo Maldonado-Agurto • Christian Hodar • Camilo Valdivieso

DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.ygeno.2021.12.018

The Chilean socio-ethno-genomic cline

• E. Barozet • Alex Di Genova • C.Y. Valenzuela • L. Cifuentes • R.A. Verdugo

DOI: http://dx.doi.org/10.1080/19485565.2021.1879626

The transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae

• Parisot • N • Vargas-Chávez • C • Goubert

DOI: http://dx.doi.org/10.1186/s12915-021-01158-2

Efficient hybrid de novo assembly of human genomes with WENGAN

• Alex Di Genova • Elena Buena-Atienza • Stephan Ossowski • Marie-France Sagot •

DOI: http://dx.doi.org/10.1038/s41587-020-00747-w

Development of a small panel of SNPs to infer ancestry in Chileans that distinguishes Aymara and Mapuche components

• Verdugo • R.A • Alex Di Genova • Herrera • L

DOI: http://dx.doi.org/10.1186/s40659-020-00284-5

Whole Genome Sequence, Variant Discovery and Annotation in Mapuche-Huilliche Native South Americans

• Elena Victoria Romo Vidal • Tomás C. Moyano • Bernabé I. Bustos • Eduardo Pérez-Palma • Carol Moraga

DOI: http://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-39391-z

Genome wide association study for resistance to Caligus rogercresseyi in Atlantic salmon (Salmo salar L.) using a 50K SNP genotyping array

• Katharina Correa • Jean P. Lhorente • Liane Bassini • Maria E. López • Alex Di Genova

DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.aquaculture.2016.04.008

The bioleaching potential of a bacterial consortium

• Mauricio Latorre • María Paz Cortés • Dante Travisany • Alex Di Genova • Marko Budinich

DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.biortech.2016.07.012

The Atlantic salmon genome provides insights into rediploidization

• Sigbjørn Lien • Ben F. Koop • Simen R. Sandve • Jason R. Miller • Matthew P. Kent

DOI: http://dx.doi.org/10.1038/nature17164

Genomewide single nucleotide polymorphism discovery in Atlantic salmon (<i>Salmo salar</i>): validation in wild and farmed American and European populations

• J. M. Yáñez • S. Naswa • M. E. López • L. Bassini • K. Correa

DOI: http://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.12503

The BioMart community portal: an innovative alternative to large, centralized data repositories

• Damian Smedley • Syed Haider • Steffen Durinck • Luca Pandini • Paolo Provero

DOI: http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv350

A new genome of Acidithiobacillus thiooxidans provides insights into adaptation to a bioleaching environment

• Dante Travisany • María Paz Cortés • Mauricio Latorre • Alex Di Genova • Marko Budinich

DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.resmic.2014.08.004

Construction of Reference Chromosome-Scale Pseudomolecules for Potato: Integrating the Potato Genome with Genetic and Physical Maps

• Sanjeev Kumar Sharma • Daniel Bolser • Jan de Boer • Mads Sønderkær • Walter Amoros

DOI: http://dx.doi.org/10.1534/g3.113.007153

Genome wide identification of Acidithiobacillus ferrooxidans (ATCC 23270) transcription factors and comparative analysis of ArsR and MerR metal regulators

• Christian Hödar • Pablo Moreno • Alex Di Genova • Mauricio Latorre • Angélica Reyes-Jara

DOI: http://dx.doi.org/10.1007/s10534-011-9484-8

Genome sequence and analysis of the tuber crop potato

• The Potato Genome Sequencing Consortium • Alex Di Genova •

DOI: http://dx.doi.org/10.1038/nature10158

BioMart Central Portal: an open database network for the biological community

• Jonathan M. Guberman • • J. Ai • O. Arnaiz •

DOI: http://dx.doi.org/10.1093/database/bar041

SalmonDB: a bioinformatics resource for Salmo salar and Oncorhynchus mykiss

• Alex Di Genova • Luis Zapata • Mauricio González • Alejandro Maass • Patricia Carolina Iturra Mira

DOI: http://dx.doi.org/10.1093/database/bar050

Proyectos

  • ● Marzo 2022

Nuevos métodos computacionales para caracterizar la arquitectura genética e impacto funcional de reordenamientos genómicos complejos en cánceres prevalentes de la población Chilena.

Investigador/a Responsable
  • ● Marzo 2022

Nuevos métodos computacionales para caracterizar la arquitectura genética de reordenamientos genómicos complejos en cánceres Chilenos

Investigador/a Responsable
  • ● Enero 2022
  • ● Enero 2023

Análisis multi-ómico de cultivares de almendro (Prunus dulcis L.) con fenotipos contrastantes en respuesta a estrés hídrico

Responsable Alterno
  • ● Enero 2022
  • ● Enero 2026

New computational algorithms to elucidate the genetic architecture and functional impact of large-scale rearrangement in prevalent Chilean cancers.

Investigador/a Responsable
  • ● Enero 2022
  • ● Enero 2032

CUARTO CONCURSO NACIONAL DE FINANCIAMIENTO BASAL PARA CENTROS CIENTÍFICOS Y TECNOLÓGICOS DE EXCELENCIA – PIA: Center for Mathematical Modeling.

Co-Investigador/a
  • ● Diciembre 2021
  • ● Noviembre 2024

Systems Biology Center for the study of extremophile communities from mining tailings. Anillo ACT210004.

Co-Investigador/a